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SWATH定量蛋白质组学

服务简介

SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 博士及其团队与AB-SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。SWATH采集模式将扫描范围划分为以25 Da为间隔的一系列区间,通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息,是 MS/MSALL技术的扩展。SWATH技术是一种真正全景式的、高通量的质谱技术,同时也大大提高了定量的可重现性。

技术特点

灵敏度高:SWATH技术利用高分辨率的TripleTOF 5600 +系统,达到了与MRM相当的定量灵敏度;

五分时时彩官网重复性好:重复样品间的定量相关性可达到0.99以上;

定量准确度高:定量准确度几乎与MRM技术相当;

线性动态范围广:定量范围可跨越4个数量级;

通量大:一次实验可检测到2000种以上蛋白并定量。

适用范围

药物作用靶点研究;

疾病标志物筛选;

植物胁迫/抗逆研究;

作用机制研究;

物种蛋白质草图构建;

要求物种含有已完成全基因组测序或转录组测序注释的CDS信息。

客户提供

需鉴定的样品;

样品信息单:需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

最终交付

实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。

生物信息学分析内容包括:

SWATH 参考谱图数据库构建:通过DDA模式的扫描结果,谱图数据库构建、全谱鉴定及结果可靠性评估;

SWATH定量:根据二级碎片离子的全扫描结果实现二级离子的定量,SWATH结果可靠性分析,差异表达分析,层次聚类,PCA分析等;

蛋白质功能注释:包括GO注释、COG分类和KEGG Pathway分析;

差异蛋白功能富集:包括GO富集、Pathway富集;

差异蛋白网络互作:基于STRING 数据库的PPI分析,基于Cytoscape的可视化展示。

服务周期

自送样起45个工作日。

如何订购

1. 邮件订购:请点击此处下载“蛋白质组学项目信息咨询单”,详细填写信息后,发送至邮箱proteome@genecreate.com

2. 在线咨询:点击屏幕右侧“在线咨询”,或拨打咨询电话027-62431110,我们会尽快安排工作人员与您联系!

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